Нови полимерни и природни агенти за контрол на бактериалната вирулентност

Проект КП-06-Н41/8

Ръководител:

гл. ас. Цветелина Паунова-Кръстева

Базова организация:

Институт по микробиология „Стефан Ангелов“, Българска академия на науките

Партньорски организации:

Институт по полимери, България академия на науките

Начало:

30 ноември 2020г.

Продължителност:

36 месеца

Резюме на проекта:

Откритието и развитието на антибиотиците изигра решаваща роля в борбата с инфекциите. За съжаление обаче то е съпътствано с бързо нарастващи рискове за поява и разрастване на антибиотикова резистентност. Днес човечеството е изправено пред една неотложна необходимост: развитието на нови перспективни подходи за борба с инфекциите при намаляване на риска от развитието на лекарствена резистентност. Успоредно с търсенето на нови антибиотици вниманието се насочва към разработката на нетрадиционни основни или съпътстващи средства за терапия. Важна нова концепция, която все повече привлича интерес, е т.нар. антивирулентна терапия. В основата на тази концепция е възможността вместо да убиваме микроорганизмите (което е причина за селекционирането на резистентни щамове), да бъде потисната тяхната вирулентност и експресията на фенотипове, свързани с нея. Очаква се по този начин при развитието на инфекция да се ограничи способността на бактериите да използват адаптивните си механизми за оцеляване и завземане на нови ниши. В рамките на тази концепция, настоящият проект има за цел разработването на нови средства за потискане на вирулентността на бактериите. Фокусът поставяме върху възможностите за въздействие върху регулаторните механизми на вирулентността чрез т.нар. кворум сенсинг (КС) и върху образуването на многоклетъчни бактериални съобщества – биофилми, в които бактериите са предпазени както от достъпа на антибактериални препарати, така и от защитните механизми на макроорганизма. В проекта ще се разработват два типа агенти с антивирулентен потенциал. Едните представляват нови полимерни наноструктурирани материали, способни да атакуват и разрушат бактериалните биофилми в отсъствието или присъствието на натоварени в тях активни субстанции. Очакваме разработеният нов дизайн на тези полимерни материали да им даде възможност да взаимодействат с екзополимерите на биофилма и да нарушат неговата здравина. Така, например при натоварване с антибиотик, следва ефективните антибиофилмни дози да бъдат съществено понижени, а антибиофилмната активност – силно повишена. Другата група реагенти с очаквани антивирулентни свойства ще търсим сред нискомолекулните метаболити на различни лечебни растения. На настоящия етап добра перспектива очакваме при сесквитерпеновите лактони поради структурните им сходства с хомосерин лактоновите сигнали от КС на бактериите. Не бива обаче да се пренебрегва потенциалът на други групи съединения при потискането на КС и биофилм образуването. Методологично, изследванията включват начален широкомащабен скрининг и последващо идентифициране на активностите при различни нива на пречистване. За осъществяване на целите на проекта е сформиран мултидисциплинален екип от специалисти по полимери, фитохимия, микробиология, клетъчна биология и имунология. Новосинтезираните агенти и фитомолекули ще бъдат изследвани с два типа скрининг протоколи – за проверка на ефектите върху КС и образуването на биофилми. Следва проверка на биосъвместимостта на перспективните препарати чрез тестове за цитотоксичност. Веществата, показали обещаващ потенциал и ниска цитотоксичност, ще са предмет на последващ комплексен ин ситу анализ, включващ ефектите върху виталността на микробите, механизмите на действие, структурните ефекти върху отделните клетки и биофилма. Анализите ще се проведат първоначално върху моделни щамове Грам-положителни и Грам отрицателни микророрганизми. Валидността на наблюдаваните явления впоследствие ще проверяваме върху клинични изолати – уропатогенни E. coli, муковисцидозни изолати от P. aeruginosa, MRSA. Със селектирани перспективни химични агенти ще се проведат и ин виво тестове върху миши модел на кожни биофилмни инфекции. Очаква се в резултат на комплексните мултидисциплинарни изследвания да бъдат идентифицирани нови перспективни средства за антивирулентни въздействия.

Project Novel polymeric and natural agents for control of bacterial virulence

Project КП-06-Н-43/8

Coordinator:

Assis. Prof. Tsvetelina Paunova-Krusteva

Base organization:

The Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences

Partner organizations:

Institute of Polymers – Bulgarian Academy of Sciences

Start:

November 30, 2020

Duration:

36 months

Summary:

While the development of antibiotics resulted in remarkable advances in the fight against infectious microorganisms, it was unfortunately paralleled with the highly increasing risks for the development of antibiotic resistance. Resistance development poses the urgent question for the discovery of novel prospective approaches to the fight against multidrug resistant bugs. Together with the search of novel antibacterials, a growing interest occurs in non-traditional approaches, among which are the attempts, instead of killing the bacteria, to suppress the bacterial virulence and the development of virulence-related phenotypes. This is expected to help prevent the adaptation of the pathogens for survival under unfavorable environmental conditions, including these in the infected host. The aim of the project is the elaboration of novel reagents capable to suppress bacterial virulence. Among the adaptive phenotypes we shall address the bacterial regulatory mechanisms of virulence expression via quorum sensing (QS), and the formation of multicellular communities – biofilms, that protect the bacteria from the host defenses and antibacterial substances. The project will focus on the development of two types of antivirulence agents. One is the elaboration of novel polymeric nanostructured materials capable to attack and destroy bacterial biofilms, either by themselves or as carriers for active substances. Interference of polymeric nanostructures with the biofilm extracellular substances are expected to loosen the biofilm matrix and facilitate access of the delivered antibacterials. These newly designed nanomaterials are expected to significantly lower the antibiotic effective doses meanwhile increasing the effectiveness of biofilm destruction. The other group of reagents with expected antivirulence efficacy will be sought among low mwt metabolites of different medicinal plants. Highest are the expectations to sesquiterpene lactones that have structural similarities with the homoserine lactone signals of bacterial QS. Other classes of substances should however not be neglected. Methodologically, all studies will include initial screening followed by identification of the activities at different purification steps. For the tasks of the project, a multidisciplinary team has been formed: specialists in polymer sciences and phytochemistry, microbiologists, cell biologists and immunologists. After the synthesis of polymeric nanoparticles or the isolation of plant substances, screening protocols will include effects on QS, inhibition of biofilm growth and destruction of pre-formed biofilms by model Gram-positive and Gram-negative strains. As a next step, the biocompatibility of the shortlisted prospective agents will be checked by cytotoxicity trials. The successful agents that combine good potential with low cytotoxicity will be included in further detailed tests in order to examine their mode of action and effects on the structure of bacterial cells and biofilms using in situ on cultured bacteria and their biofilms. These trials will initially involve Gram-positive and Gram-negative reference strains as models. The ubiquity of the effect of selected reagents registered with the model strains will be further checked for activity on clinical isolates – MRSA, cystic fibrosis isolates of P. aeruginosa, and clinical isolates of uropathogenic E. coli. In addition, in vivo mouse model for skin biofilm infection will be specifically adapted purposes of this project and will be applied with the potentially effective substances. This complex multidisciplinary approach is expected to identify prospective agents for antivirulence treatments.